クローンブレイドの更なる開発のため、捕獲した雅音とウィッチブレイドのデータ解析を急ぐ西田は、かつて「ウィッチブレイド適合者」と見なされていた筈の玲奈のデータに異変が生じていることを発見する。一方、鷹山らの手配により、NSWFから無事救出された雅音であったが、再会を喜ぶ雅音と梨穂子を待ちうけていたのは、意外な事実であった。

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