とある施設に拘束されていた新人類・ルーシーは、ある日偶発的事故がきっかけで警備員たちを殺害し脱走する。一方、大学入学のため鎌倉へやって来た大学生・コウタは、幼馴染のユカと再会。二人は由比ヶ浜で、「にゅう?」としか話さない不思議な少女と出会う。彼女を「にゅう」と名づけ、部屋へと連れて行くが、その少女こそ・・・・・・。

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