ジャンバ博士の宇宙スクーターで暴走遊びをしていたスティッチは追っ手をかわすうち、勢い余って宇宙嵐に巻き込まれてしまう。時空を越えてスティッチが不時着したのは、ジャパンの最南端の島、イザヨイ島だった。
空腹のため食べ物を探すスティッチは、あちこちで大騒動を繰り広げ、島は大パニック。やっと空腹を満たし、森の中で寝ていたスティッチを、この島に暮らす少女ユウナが見つける。空手の師範代で正義感の強いユウナはスティッチを成敗しようとするが・・・。

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