宇宙空間に浮かぶ研究所で、イザヨイ島のスティッチたちの様子を偵察していたハムスターヴィール博士は、イイコトカウンターを手に入れれば宇宙一の力が手に入ると思い込む。そこで捕獲しておいた黄色の宇宙生命体に、自分の命令に従う「悪い子カチューシャ」を装着し、スティッチからイイコトカウンターを奪うよう命ずる。
やがて謎の"オバケ"の襲来でイザヨイ島に大パニックが巻き起こる。騒ぎを聞きつけたユウナとスティッチは、意気込んでオバケ退治に乗り出すが、そのオバケがスティッチの"イトコ"だったことに気づき...。

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