ある日、ちたまの石の力を狙う海賊、ロック一味がイザヨイ島に上陸する。ロック一味はちたまの石の力を利用して、海底深くに沈んでいる伝説の海賊「カーン」の船を引き上げたいのだという。興味津々のスティッチはロックたちを差し置き潜水スーツを着て海に潜ると、カーンの沈没船を引き上げることに見事成功する。ところがそのとき、船と一緒に封印されていた邪悪な海賊カーンが200年の眠りから目を覚ましてしまう。

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