日向咲はある日、美翔舞という少女と出会う。彼女は幼い頃の夏祭りの夜に出逢った女の子だった。再会の感慨に浸っている間もなく、二人の前に花の精・フラッピと鳥の精・チョッピが現れる。フラッピとチョッピは謎の怪人・カレハーンに追われていた。咲と舞は伝説の戦士・プリキュアに変身し、カレハーンに立ち向かう!

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