ホエーモンの協力で進化の鍵となるタグを手に入れ、希望もあらたに航海を続ける子供たち。ついにサーバ大陸に上陸!だが、上陸してたどりついたのは、意地悪で有名なパグモンたちの村!警戒するなか、パグモンの意外な歓待におどろく子供たち。だが、そこには、新たな敵、エテモンの罠が…。

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