Code：Realize～創世の姫君～

猛毒を宿す少女・カルディアは、怪物として恐れられ、一人屋敷に閉じこもっていた。ある夜、英国軍に捕らわれそうになり、「泥棒紳士」アルセーヌ・ルパンに盗み出される。彼に連れられ訪れたのは機鋼都市・ロンドン。そして自分が連れ去られた理由を聞かされるのだが、それは大きな陰謀にまつわるものだった。

• 第2話 ザ・ストロンゲスト・ストーカー
• 第3話 ヴァンパイア・レクイエム
• 第4話 トレイン・スナッチ
• 第5話 ネゴシエイテッド・ソリューション
• 第6話 イリーガル・レース
• 第7話 いつかの許し
• 第8話 戦火
• 第9話 祈り
• 第10話 約束
• 第11話 Code：Realize
• 第12話 ぬくもり

• 第2話 ザ・ストロンゲスト・ストーカー
• 第3話 ヴァンパイア・レクイエム
• 第4話 トレイン・スナッチ
• 第5話 ネゴシエイテッド・ソリューション
• 第6話 イリーガル・レース

• 第7話 いつかの許し
• 第8話 戦火
• 第9話 祈り
• 第10話 約束
• 第11話 Code：Realize
• 第12話 ぬくもり

ルパン一味の隠れ家は貴族のサンの屋敷。主のサンから何か告げられるカルディア。そしてフランの分析で、身体の毒が埋め込まれたホロロギウムが原因と判明。ルパンはカルディアを連れて繁華街を訪れるが、【黄昏】なる組織に襲撃される。辛うじて逃げ延びた先には二挺のショットガンを構えた男が立ちふさがっていた。

ロンドンでは吸血鬼一族の宝を狙う「月下の怪盗」が出没しており、ヴァンには何か思うところがあるらしい。一方、ルパンはフィーニスを捕獲すべく大胆な作戦を立てる。カルディアも作戦に参加することになり、仲間たちの特訓を受けることになる。そして特訓の仕上げに「月下の怪盗」を捕まえることになるのだが…

フィーニス捕獲計画を実行に移すルパン一味。順調に進んでいるように見えたが、ルパンの前にエルロック・ショルメが立ちはだかる。彼はヴィクトリアの依頼を受け、フィーニスの護衛をしていた私立探偵だった。窮地に陥るルパンは計画を進めるため、カルディア一人を先に行かせる。果たして計画は完遂できるのか?

列車爆破事件の指名手配犯とされたルパンたちはアイザックの手がかりを追う為のロンドンでの行動が難しくなる。そしてある夜、フランは何も告げずに屋敷を抜け出すが、彼の身を案じるカルディアに見つかり、その真意を訪ねられる。フランの目的は女王のヴィクトリアと交渉するつもりだったのだ。

「アイザックの遺稿」を手に入れる為、飛行船レースに参加するルパンたち。レース用に改造するインピーだが、作業が進まず、辛うじてレース開始時間に間に合う。レースにはネモと名乗る風変りな科学者もエントリーしていた。ついにレースが始まり、インピーたちの飛行船は幸先のよいスタートを切ることができたのだが…。

アイザックの研究所でカルディアは自らの出生の事実を知る。思い悩む彼女はルパンたちの元を去ることを決意する。帰途、彼女はかつて村で起きた出来事を回想する。怪物だと追い立てられ、逃げ惑う中一軒の家に辿り着く。そこでエレインという女性と出会うのであった。

カルディアを捜索しているヴァンたち。最中、市内でアイザックによるテロが始まってしまう。そして英国軍でもクーデターが起こる。ロンドンに戻ったルパンとカルディアは仲間たちと合流。再会を喜びつつ、ヴィクトリアの救出に向かう。一方、別行動をとっていたサンの前に、鎧姿の女性が姿を現していた。

ロンドンを占拠したフィーニスは「コード:リアライズ」計画を進める。一方、自身を「イデアの使徒」と名乗るサンはその使命として、計画発動の鍵となるカルディアに、自ら命を絶つようにと説く。また傷を負ったルパンのもとには、ヴァンが訪れていた。カルディアの立場に思い悩むルパンにヴァンは…。

黄昏の本拠地に進む英国軍。彼らを陽動部隊とし、ルパンたちは聖堂内に潜入を果たすが、そこにはヴァンの元上官であるアレスターが待ち受ける。苦戦するヴァンはサンに後を託し、ルパンたちは先を急ぐ。中心部には巨大な天球儀があり、フィーニスが姿を現す。ヴァンは情報を引き出すためフィーニスに迫るのだが…。

ノーチラスに捕らわれたカルディア。単身乗り込もうとするルパンを制止するヴァンだが、カルディアへの思いを改めて知り協力を申し出る。そんな二人にフランが、カルディアと世界を救うための方法を提案する。併せてサンからの協力――イデアの協力を受け、英国軍とともに、ルパンたちは飛行船でノーチラスへと向かう。

天球儀に取り込まれたカルディアは、父アイザックの記憶を見る。そこには彼が狂気に憑りつかれるに至る悲劇があった。アイザックの野望に呑み込まれそうになるカルディアだが、再び駆けつけたルパンによって救い出される。アイザックと対峙する中……既に「コード:リアライズ」は達成され、アイザックは自らを世界を統べる神だと宣言する。