ナチス・ドイツの保養施設から、何故か日本の国宝級の文化財「地獄如来像」が発見される。それはルパンが狙っているお宝「風神」を手にいれるための手がかりとなる仏像。ルパンはその仏像を盗もうとするが、謎の忍者強盗集団を組織するモルガーナに奪い取られ、その時銭形は殺されてしまう…。
ルパンは、亡き銭形のためにもモルガーナが狙っている「風神」の秘密に迫る。だがそこに「風神」を狙う女忍者・飛鳥と忍犬・虎太郎の陰が…。ルパン、モルガーナ、飛鳥の三つ巴の壮絶なお宝争奪戦の末、ルパンは宝に秘められたとんでもない謎を知ることになる…。