地球上最強の暗殺拳法『北斗神拳』千八百年の歴史の中、誰もが天才と認めた男、その名はトキ。『北斗神拳』は一子相伝であり、伝承者に選ばれし者は乱世において救世主の運命を負うとされる。
北斗の掟に翻弄されるトキ。彼には誰にも明かさぬ秘密があった。それを知るのは唯ひとり、女医のサラのみ。やがて世界は核の炎に包まれ無秩序と暴力の支配する有史以前の状態へ……。
トキは人々を救うため北斗神拳を医療に活かすべくサラとともに荒野へと旅立つが、自らの覇業を成し遂げようとする長兄ラオウが行く手を阻む。そしてラオウは監獄カサンドラへトキを閉じ込めた─。永き幽閉のあと、末弟ケンシロウによって救いだされたトキ。すでに自らの死期を悟っていた彼はラオウとの「約束」を果たすことを決意する。
血を分けた兄弟の約束とは?トキがケンシロウに託した願いとは? 知られざるトキの思いが今ここに明らかになる。