遊☆戯☆王5D’s(第1話～第77話)

武藤遊戯がいた時代から数十年後の童実野町。そこは貧富の差などから分けられた階級社会ネオ童実野シティへと変貌を遂げていたい。サテライトエリアにいる不動遊星はライバルであり、現在ライディング・デュエルのチャンピンであるジャック・アトラスのいるいるトップスエリアを眺めていた。あの場所に行き、目的を果たすと誓い。遊星の仲間であるラリーが、デュエルデスクの発展系であるD・ホイールの部品を手に入れ、遊星のもとにやってくる。受け取る遊星のもとに治安維持局のセキュリティが包囲するのであった。仲間のラリーをかばおうとする遊星はセキュリティにデュエルを挑むのであった。遊星とセキュリティの一人牛尾のライディング・デュエルが始まるのであった。

サテライトの工場で働いていたナーヴやタカやブリッツたちの前にシティから来たという瓜生たちが絡んでくる。一方、遊星はジャックからあるものを取り返すためにD・ホイールの整備を行っていた。そんな遊星のところに瓜生に殴られらナーヴたちが戻ってくるのだが、瓜生たちも因縁をつけにくるのであった。そして遊星のD・ホイールをかけてデュエルをするようと強要する。遊星と瓜生のデュエル。瓜生はいきなり攻撃力2400の電動刃虫を召喚する。一方、遊星はシールド・ウォリアーを守備表示で召喚するのであった。

ジャックのいるネオ童実野シティの中心部に向かう遊星。ラリーは自分の大切なカード「ワンショット・ブースター」手渡し、応援するのであった。唯一、ネオ童実野シティとサテライトを結んでいるパイプラインを目指して走る遊星の前にまたもや現れるセキュリティの牛尾。牛尾は特殊追跡デッキを用い、強制的にデュエルするのであった。時間内にパイプラインを突破しなければならない遊星に対してあえてスピードワールドの効果がうけられないゲートブロッカーを召喚する牛尾。その壁を突破するために遊星はスピード・ウォリアーを召喚し対抗するのであった。

パイプラインを突破した遊星の前に立っているジャック。それぞれの思いを胸に遊星のエースカード「スターダスト・ドラゴン」をかけてライディング・デュエルを行うことに。観客のいないデュエル・スタジアムに対峙する遊星とジャック。静寂の中で2台のD・ホイールが動きだす。遊星はボルト・ヘッジホックを守備表示で召喚し、対してジャックはマッド・デーモンを召喚し、攻撃をしかける。

ジャックは自分のエースモンスターである「レッド・デーモンズ・ドラゴン」を召喚し、さらに遊星のエースモンスターである「スターダスト・ドラゴン」をも召喚するのであった。追い込まれる遊星は反撃の糸口をさぐるべくバトルで破壊されないロードランナーを召喚する。デュエルだけでなく、言葉においても遊星を圧倒するジャックは2体のドラゴンで攻撃する。さらに追い込まれる遊星はトラップカード、『ハルモニアの鏡』を発動するのであった。

捕らえられた遊星は治安維持局によって頬にマーカーをつけられる。そして収容所へとおくられる遊星。その護送車の中で矢薙という老人に出会うのであった。一方、ジャックはゴドウィンたちが昨晩の戦いを見ており、そしてその戦いの結末がジャックにとって信じられないことであることを知る。収容所についた遊星たちを待ち受けていたのは、氷室という元プロデュエリスト。いきなりデュエルを挑まれるもデッキをもっていない遊星は戦えず、矢薙と氷室がデュエルをすることに。矢薙は秘宝デッキを自慢げに見せながら、デュエルを開始するのであった。先行の矢薙は水晶ドクロを召喚するのだが。

矢薙のカードをけなし、カードを踏みつけた氷室に対して、遊星は矢薙の秘宝デッキでデュエルを挑む。遊星と氷室のデュエル、氷室は攻撃力2000の地獄蜘蛛を召喚する。一方、遊星は水晶ドクロを召喚し、さらに速攻魔法「呪詛(のろい)返しのヒトガタ」発動、ダメージを氷室に与えるのであった。ダメージを食らった氷室は、遊星がデュエルを熟知していることを理解し、本気で攻める。牛鬼をリリースし、大牛鬼を召喚した氷室は遊星に大ダメージを与える。

治安維持局によって体を調べられる遊星。その目的は竜の痣の確認であった。そんな遊星の前に治安維持局長官のゴドウィンが現れる。一方、ジャックは赤き竜の伝説について知り、あえてゴドウィンに従い、キングとしてライディング・デュエルを行うことに。ジャックへの挑戦者は炎城骸という以前ジャックに負けたことがある男であった。打倒キングに燃える骸に対してジャックは、、、、

ゴドウィンから遊星を調べるように言われた収容所所長鷹栖は、遊星の仲間となった氷室や矢薙をあえて痛めつける。そして、遊星を別の部屋に移すのであった。その部屋には青山という人物があり、収容所からの脱出をはかっていた。遊星を誘う青山。が、遊星は氷室と矢薙もともに脱出したいという。そんな遊星たちの前に鷹栖が現れ仲間を罵倒し、遊星を挑発するのであった。自由をかけデュエルをする遊星。が、鷹栖によってすべてのデッキを没収されてしまうのであった。果たして遊星は。。。

収容所の仲間たちが一枚ずつ渡してくれたカードで鷹栖と闘う遊星。卑怯な手を使う鷹栖はダメージをうけると電流が流れるデュエルを行うのだが、自分には電流が流れないようにしており、遊星だけが、ダメージを受けるたびに電流をあびるのであった。さらに鷹栖はポインズ・チェーンにより遊星のデッキ破壊を目論む。

収容所から解放された遊星は氷室の紹介で雑賀という人物のもとを訪れる。遊星の目的はセキュリティによって奪われたデッキとD・ホイールを奪還することであった。雑賀と合流した遊星だったが、雑賀はセキュリティが管理する保管ビルに侵入するのはつかまるようなものだととめる。が、仲間との絆の証であるD・ホイールとデッキを奪還しにく遊星。が、そこにはやはり牛尾をはじめとしたセキュリティが待ち構えていた。

D・ホイールとデッキを奪還した遊星だったが、牛尾がまたもや行く手を阻み、ライディング・デュエルを仕掛けられる。追い込まれた遊星を救ったのは雑賀だった。雑賀の導きで難を逃れるが、牛尾の追跡はさらに激しくなる。スピードスペル!　装備魔法ラピッド・ショット・ウィング発動し、攻撃力をアップさせ、遊星にダイレクト・アタックをしかける牛尾。反撃に出る遊星だったが、牛尾がD・ホイールをぶつけてきて、思うように動くことができなかった。

D・ホイールとデッキの奪還に成功した遊星だったが、激しいバトルのすえ、気絶してしまう。遊星を助けたのはトップスエリアに住んでいる双子の龍亞と龍可だった。目覚める遊星に対して質問ぜめの龍亞、慎重な龍可。龍亞は遊星がデュエリストであることを知り、デュエルしてほしいとせがむであった。助けてもらったこともあり、龍亞とデュエルする遊星。龍亞のデッキはディフォーマーデッキ。先行した龍亞はD(ディフォーマー)・モバホン』を張り切って召喚し、ディフォーマーのモンスター効果でマグネン・Uも特殊召喚するのであった。

双子の龍亞と龍可に迷惑がかかると考えた遊星は雑賀のもとに向かった。そこで氷室と矢薙たちと再会する。再会を喜んでいた矢先、突然ジャックが現れ、スターダスト・ドラゴンのカードを受け取り、フォーチュンカップで俺と戦えというのであった。カードを受け取った遊星は。。。。

ついに開催される「デュエル・オブ・フォーチュンカップ」。デュエルキングである「ジャック・アトラス」への挑戦権をかけて。第一試合は龍可VSボマー。ところが龍可は出場せずに龍亞が変わりに出場することに。張り切る龍亞はD・フォーマー　モバホンを召喚し、D・フォーマーデッキの力を見せつけようとする。一方、ボマーは。。。

「デュエル・オブ・フォーチュンカップ」の次の対戦は謎の少女「十六夜アキ」VSジル。心正しき鉄血の騎士であるジルはアキがダイモンエリアで恐れられている「仮面の少女」としるや、容赦なく攻撃をしかけてくるのであった。ジルの攻撃を平然と受け止めたアキはシンクロ召喚によって「ブラック・ローズ・ドラゴン」を呼び出すのであった。

遊星が「デュエル・オブ・フォーチュンカップ」に登場。対戦相手は死羅という謎の男。ところがなんと、対戦相手は打倒キングに燃える炎城ムクロだった。ムクロは対キング用に組んだスピードアクセルデッキで遊星に挑み、「デス・アクセル」を発動させる。受けてたつ遊星は・・・・。

主催者レクス・ゴドウィンはある人物がシグナーかどうかを確かめるために敗者復活戦を行う。指名された龍可は強制的にデュエルをすることに。対戦者はデュエルカウンセラーのフランク教授。龍可は妖精デッキを使って戦うが、フランクは龍可の深層心理を探るようなデュエルを展開し、過去の出来事に迫り追い込んでいく。

龍可をデュエルモンスターズの精霊世界に行かせることで、シグナーとして覚醒させようとするフランク教授。フランクの深層心理をついたデュエルは、龍可を精霊世界に誘い精霊の声を聞くことになる。それは精霊世界に起こっている衝撃の事実だった。

準決勝、第一試合は「遊星VSボマー」に決まった。遊星とボマーはそれぞれの信念を持ち、激しいデュエルを繰り広げる。そして、ボマーは「ジャイアント・ボマー・エアレイド」を使い遊星に挑む。ボマーは遊星をギリギリのところまで追いつめる。果たして、2人の戦いの行方は・・・。

＜遊星VSボマー後編＞それぞれの故郷をかけたライディング・デュエル。ボマーはジャイアントボマー・エアレイドを召喚し、モンスター効果で遊星を追い込む。遊星はボマーの戦略を読み、伏せカードをセットして、反撃のチャンスをうかがう。遊星の戦略を読んだボマーは遊星にダイレクトアタックを行い一気に勝負にでるのだが。。。。

準決勝の2回戦は十六夜アキVSプロファイラー来宮。来宮はアキの十六年間の記録をもとに十六夜アキをいたぶる作戦にでる。デュエルすることで破壊を行ってしまう力を忌みきらうアキは幼いころからの出来事を読み上げる来宮に対して冷静に対処しようとするのだが。

デュエルキングのジャック・アトラスとの対戦者を決める最終戦。遊星VS十六夜アキ。遊星は前の試合で、アキのデュエルは拒絶と怒りだけではない別の感情があると感じていた。その真意を確かめるべく、決戦に向かう遊星。一方、アキは忌むべき印である竜の痣を持つ遊星を倒し、自分を保護するアルカディア・ムーブメントの理想をこの世に知らしめるために戦うと告げるのであった。

＜遊星VSアキ　後編＞十六夜のもうひとつの感情が「破壊を楽しむ」ということを知る遊星。アキの破壊行為を防ごうとジャンク・ウォリアーを召喚し、反撃にでるのだが、十六夜はそのジャンク・ウォリアーをモンスター効果でコピーし、ブラック・ローズ・ドラゴンを召喚する。ブラック・ローズ・ドラゴンに対抗するために遊星はついにスターダスト・ドラゴンを呼び出す。対峙する2体のドラゴンは、、、

十六夜アキとの戦いに勝利した遊星。だが、デュエルスタジアムは壊滅的な被害にあい、大会が続行できる状態ではなかった。遊星は大会中止を進言するためにゴドウィンのもとに向かう。そこで遊星を待っていたのはジャックだった。ジャックはゴドウィンがこの大会を開催した真の目的を告げる。

＜遊星VSジャック　後編＞ジャックはレッド・デーモンズ・ドラゴンを召喚し、遊星のジャンク・ウォリアーを破壊する。追い込まれた遊星はハイバー・シンクロンを使ってシンクロ召喚を行い、スターダスト・ドラゴンを召喚。対峙する2体のドラゴン。遊星の攻撃をかわしたジャックがレッド・デーモンズ・ドラゴンでスターダストドラゴンを攻撃したとき、再び赤い竜が出現し、デュエルスタジアムを包み込むのであった。

ジャックをやぶり、ニューキングとなった遊星。殺到する取材陣から逃れるために矢薙たちと地下通路からスタジアムを脱出する。ニューキングの取材に失敗した新聞記者カーリーは、ゴドウィンへの取材を試みるが煙に巻かれてしまう。何も情報を得ることができずにいたカーリーは、ジャックのいる病院を目指すのであった。雑賀のアジトに身を潜める遊星の前に突如、謎の痣を持つ男が現れる。一方、サテライトにおいても。。。。

謎の蜘蛛の痣のある男とデュエルする遊星。蜘蛛の痣をもつ男はダーク・チューナーを召喚し、ダークシンクロを行う。そして、氷結のフィッツジェラルドを召喚し遊星に遅いかかるのであった。魔法・罠カードを発動できない遊星は、一方的に攻撃され追い込まれる。このデュエルに偶然遭遇した新聞記者カーリーは、スクープをゲットできるチャンスが到来したと喜ぶのだが。

ゴドウィンのもとに向かった遊星。一方、カーリーは「ロード・オブ・ザ・キング」の完成披露試写会の会場に向かうのであった。そこでカーリーはジャックがサテライト出身であるということを聞き、その事実を確かめるためにジャックのいる病院へ向かう。ジャックは病院で療養していたが、そのジャックのもとに、、、、

クロウはセキュリティ保管庫からカードを盗んで逃走し、追跡してくるセキュリティと強制的にライディング・デュエルを行う。セキュリティが防御を固めるのに対し、クロウはブラックフェザーシリーズのモンスターを召喚する。一方、遊星はゴドウィンからダークシグナーに関する新たな真実を聞かされる。

クロウと再会した遊星。再会を喜ぶ二人は、ラリーたちのもとに急ぐのであった。一方、ジャックは一人街に飛び出してしまう。ラリーたちのもとに着いた遊星とクロウだが、そこにセキュリティがクロウを追って再びやって来る。遊星とクロウはタッグを組み、セキュリティとライディングデュエルを展開する。

クロウのアジトであるダイダロスブリッジで落ち合う遊星・クロウ・そしてラリーたち。クロウは子供たちにダイダロスブリッジの伝説の男の話をしてあげる。一方、街ではナスカの地上絵が消滅するという不可解な事件が起こっていた。遊星はダークシグナーのもとに向かうべく、サテライトの奥地であるB.A.Dエリアを目指すのであった。

ダークシグナーと対峙する遊星。そのダークシグナーとはかつての仲間「鬼柳京介」だった。サテライトに突如現れた炎の地上絵。その地上絵がライディング・デュエルの舞台となり、遊星と鬼柳はデュエルを始めるのであった。

遊星VS鬼柳。シグナーとダークシグナーの命を賭けた戦い。かつて遊星・ジャック・クロウ・鬼柳はサテライト統一を目指したチームの仲間だった。だが、鬼柳はダークシグナーとなり遊星の前に現れる。そして、鬼柳はエースモンスターである「ワンハンドレッド・アイ・ドラゴン」を召喚し、コンボを炸裂させ、遊星を追い詰めるのであった。

遊星VS鬼柳。遊星は鬼柳の「ワンハンドレッド・アイ・ドラゴン」のコンボを攻略すべく、スターダスト・ドラゴンを召喚し、必殺コンボを炸裂させる。だが、余裕の笑みの鬼柳は、あるカードをかざすのであった。そのカードとは、、、、、

鬼柳との戦いに負傷した遊星は、マーサのいるホームへと運ばれる。一方、龍亞はシグナーたちは協力しあってダークシグナーと戦うべきだと主張し、アキのいるアルカディアムーブメントのもとに向かうのであった。そしてアキの保護者であるディヴァインに事情を説明する龍亞だったが、、、

ジャックがゴドウィンの所に戻ってしまい、カーリーはジャックとの関係が切れないように必死になって、ジャックに関わる情報収集に励むのであった。そして、十六夜アキがいるアルカディア・ムーブメントについて調べていた時、美人モデルのミスティに関する資料を発見してしまう。ミスティのもとを訪ねたカーリーは衝撃の事実を知ることに。。。

アルカディア・ムーブメントを訪れたカーリーは、様々な秘密を知ってしまいディヴァインとデュエルを行うことに。彼のサイコ・パワーによりビルから転落するカーリー。その時、激震が走りハチドリの地上絵がアルカディア・ムーブメントのビルを中心に出現する。そして、ダークシグナーとして蘇ったカーリーは再びディヴァインのもとに現れ、決闘を挑むのであった。

アキのもとに訪れたのはダークシグナーとなったミスティだった。アキと命をかけたデュエルを展開するダークシグナーのミスティ。アキはブラック・ローズ・ドラゴンを召喚し、それに対抗するミスティは地縛神コカライアを召喚する。そしてミスティは、アキへ復讐の理由を告げるのであった。

病院に担ぎ込まれた十六夜アキ。意識不明のアキを心配し両親が病院に駆けつけるがアキの意識は全く戻らない。ジャックの進言でアキの父親は遊星をサテライトから連れて来る。そして、遊星がアキのもとに行くと竜の痣が光り、アキは意識を取り戻すのだが。

遊星VSアキ。アキはブラック・ローズ・ドラゴンを召喚し、装備魔法「憎悪の棘」を発動させ、遊星のライフとスターダスト・ドラゴンの攻撃力を削る。遊星は痛みに耐え、アキに「帰る場所はある」と訴え続けるが、アキの力はますます増していく。

ゴドウィンの屋敷に集まる遊星、ジャック、アキ、龍可、龍亞。ゴドウィンはシグナーである彼らに「シグナーとしての宿命が一人一人の運命を結びつけ、導いている」と語りかけるのであった。そして、遊星とジャックがスターダスト・ドラゴンをかけて戦ったのは赤き龍によって導かれたと・・・。

ゴドウィンとの会談後、かつての仲間だった鬼柳がダークシグナーになったことを思い悩む遊星。一方、サテライトではクロウがダークシグナーを倒すために最深部に進入しようとしていた。そこでクロウはイェーガーと遭遇する。イェーガーの企みを確認する為にデュエルへと突入するのであった。

クロウVSイェーガー。イェーガーはシンクロ召喚封じを行い、さらにジェスター・コンフィのモンスター効果で相手モンスターの召喚を無効にする。追い込まれたクロウは、速攻魔法リロードを行うことでカードを2枚ドローし、不敵な笑みを浮かべカードを一枚伏せるのであった。

牛尾が運転するヘリでサテライトに向かう遊星、ジャック、アキ、龍亞、龍可、深影。マーサのもとにたどり着き再会を喜ぶ。しかし、クロウとラリーたち4人が行方不明であることを聞き緊迫するシグナーたち。一方、牛尾は深影のことが気になってしょうがなく、深影のもとに向かう。そんな彼らのもとに怪しい影が落雷とともに現れるのであった。

ダークシグナーのボスである「ルドガー」と対決する遊星。遊星とルドガーが戦う地上絵の中にマーサハウスの子供が入ってきてしまい、遊星は子供達を救い出そうとするが、ついにルドガーは地縛神を召喚してしまう。子供達の魂を地縛神に吸収されそうになった時、ジャックが現れなんとか子供達を救出するのだが、、、

マーサとラリーがダークシグナーの犠牲になり悲しむ遊星たち。だが、ダークシグナーを倒せば彼らは蘇るのではないかという希望を胸に、遊星たちは決戦の地に向かう。その時、ダークシグナーは旧モーメントを制御している4つの制御装置にそれぞれが待ち受けていた。そして、龍亞と龍可はエンシェント・フェアリー・ドラゴンのカードをもつディマクのもとに向かう。その道中で、龍可は。。。。

精霊の世界に迷い込んだ龍可。そこはすべてのものが、反対に動く世界だった。エンシェント・フェアリー・ドラゴンが教えてくれたしもべであるレグルスを探す為に街をさまよっていると、精霊を捕獲している兵士に出会い追われることに。一方、龍亞は龍可の代わりにダークシグナーであるディマクと命をかけたデュエルを行っていた。相手の戦略を考え、何とか凌ぎきる龍亞だったが。

やっとレグルスに会うことができた龍可。だが、レグルスの足には「カースド・ニードル」がついており、龍可の言葉の意味を反対に受け取り、襲い掛かってくるのであった。一方、ディマクと戦う龍亞はエースモンスターであるパワー・ツール・ドラゴンを召喚し、パワー・ツール・ドラゴンの効果を使い、何とかディマクの攻撃を防ぐのだが。。。。

精霊世界で、レグルスと共に猿魔王ゼーマンのもとに向かった龍可。龍可達は知恵を絞り、なんとか猿魔王ゼーマンのもとからエンシェント・フェアリー・ドラゴンを解放しようとする。一方、同時刻の現実世界では、龍亞はディマクが召喚した猿魔王ゼーマンの攻撃を凌ぎディマクを倒すがその時、ディマクはついに地縛神クシルを召喚してしまう。

ダークシグナーであるディマクを倒した龍可は無事エンシェント・フェアリー・ドラゴンの解放に成功するのであった。一方、生死不明だったクロウはBAD付近で無事生きていたが、クロウが世話をしていた村の子供たちはみんな姿を消していた。そして、ダークシグナーに対して怒り心頭のクロウはダイダロスブリッジから見える巨人の塔を目指すのであった。

クロウVSダークシグナー・ボマー。二人の戦いを止めにきた遊星。だが、遊星に対してクロウはこの復讐の闘いを続けさせてくれと懇願する。その理由とは幼きころ、孤独なクロウに文字の読み書きや戦略などを教えてくれたのはデュエルモンスターズのカードであり、またこのカードが友達を増やしてくれたと。そんなつらい思いは子供たちにさせたくないという思いから子供たちに接してきたクロウ。その子供たちを消したダークシグナーは許せないと。

ダークシグナー・ボマーはダークシンクロモンスター「ダーク・フラット・トップ」を召喚させ、ジャイアント・ボマー・エアレイドを復活させるのであった。追い込まれるクロウだったが、トラップカード「ブラック・フェザー・バックフラッシュ」でモンスターを全破壊するのであった。だが、ついにボマーは地縛神「チャク・チャルア」を召喚する。

遊星と鬼柳の決着をつける戦いがはじまる。鬼柳は前回同様にハンドレスコンボを狙ってインフェルニティと名のつくモンスターで攻撃してくる。一方、鬼柳を救うために戦うと決意した遊星。チーム・サティスファクションに起こった忌まわしい事件が二人を戦いに導いているのであれば、必ず鬼柳を救えると信じて遊星は戦うのであった。

遊星はチームサティスファクション時代の誤解を解き、鬼柳を救おうと必死に戦うが、鬼柳はそんな遊星をあざ笑うかのように地縛神コカパク・アプを召喚するのであった。スターダストドラゴンで対抗する遊星。一進一退の攻防を繰り広げる遊星と鬼柳だったが、、、、

鬼柳を倒した遊星は、ダークシグナーのボスであるルドガーがいる旧モーメントへ向かうのであった。ルドガーと対峙した遊星。ルドガーは遊星の父親である不動博士との決着をつけるといい旧モーメントエネルギーが吹き出る場所で戦いを挑んでくるのであった。

遊星VSルドガー戦の後編。ルドガーは地縛神ウルを召喚し、遊星を追い込む。
ライフを削られ追い詰められていく遊星に、ルドガーは冥土の土産にと、遊星の父・不動博士とルドガーの間で起こった旧モーメントをめぐる悲劇を語るのであった。

対峙するジャックとカーリー。カーリーの真意を確かめたいジャックに対して、運命に従い、命をかけて闘えと迫るカーリー。ついに二人のデュエルが始まる。
しかしジャックは、モンスターも召喚せずカードを伏せる事なくターンを終了するのであった。

ダークシグナーの呪縛から解放したいと願うジャックは、トラップカードの効果の選択をカーリーに託す。その思いが通じ、正気をとりもどしたかに見えたカーリーだったが、地縛神の邪悪な力により、闘いは続く。ジャックは意を決して、レッド・デーモンズ・ドラゴンを召喚する。

アキVSミスティ　『蜥蜴の塔』に向かうアキ。待ち受けていたミスティはアキに過去の悲劇を語りはじめる。一方、アキを追っていた遊星は、セキュリティを名乗る男と遭遇する。

十六夜アキをマインドコントロールし、ミスティとデュエルを行わせるディヴァイン。遊星は阻止すべく、ディヴァインと対峙する。その戦いの中、遊星はある真実を気付くのであった。その真実とは。。。

サテライトにある旧モーメントから「冥界の王」が出現し、シティを目指して動きだす。
一方、遊星たちは『赤き龍』の導きにより、レクス・ゴドウィンのもとに向かうのであった。「シグナーとダークシグナー」の二つの力を得たレクスは「冥界の王」を迎える儀式としてシグナーを生贄にするライディング・デュエルを行うと宣言する。ついに遊星・ジャック・クロウVSレクスの3対1のデュエルが始まるのであった。

遊星・ジャック・クロウVSレクス。遊星たちは、攻撃をチェーンさせ、三人の力を合わせて攻める。レクスは太陽龍インティと月影龍クイラを巧みに使い、攻撃をかわすのであった。ついに地縛神ウィラコチャ・ラスカを召喚したレクスは。。。。

レクスが召喚した地縛神ウィラコチャ・ラスカの攻撃で、ジャックまでもが戦線を離脱することに。二人の思いを引き継いだ遊星はレクスと真っ向勝負を挑むが、地縛神の効果によりライフを「1」にされてしまう。勝利への希望捨てず戦う遊星は。。。。

ゴドウィンとの戦いから半年後、シティとサテライトは一つになり、復興作業が進んでいた。遊星たちは1年後に行われる「ワールド・ライディング・デュエル・グランプリ」を目指し、マシンの開発をしていた。平和な日常を楽しむ遊星たちの所に、謎のD・ホイーラー「ゴースト」が出没し、次々とD・ホイールを破壊していると噂が舞い込む。捜査の協力を仰ぐ深影と牛尾に対して遊星たちは。。。。

謎のD・ホイーラー「ゴースト」の正体を突き止めるためにライディング・デュエルを行う遊星。
5体の合体モンスター「機皇帝ワイゼル」を召喚し、攻撃をしかけてくるゴーストに対して、スターダスト・ドラゴンで対抗するのだが。。。。。

龍亞と龍可はデュエルアカデミアの小等部に通っている。そんな彼らのクラスに危機が迫っていた。
成績の低い龍亞たちのクラスを閉鎖し、クラスメイトたちを退学させると教頭が宣言したのである。
一方、遊星の前に謎の男が現れ、修理の依頼をするのであった。その依頼内容とは。。。

久しぶりに旧サテライトエリアに向かう遊星・ジャック・クロウ。マーサとの再会を喜んでいたが、ある頑固な老人「鉄蔵」の話を聞く。鉄蔵は遊星たちを家に近づけないように様々なトラップを仕掛ける。その理由とは。。。。

1年後に開催される『ワールド・ライディング・デュエル・グランプリ』を目指し地道に働く遊星とクロウ。ジャックは働かずに余裕な態度をとってた為、怒ったクロウはまじめ働く少年「マルコ」を見習えと攻め立てる。奮起したジャックは働き始めるのだが。。。。

龍亞・龍可・天兵は探検遊びをしにある森に来ていた。その森は「神隠し」が起こると噂されている森で、龍可は謎の声を聞き行方不明になってしまう。必死に龍可を探す龍亞。天兵から事情を聞いた遊星も森に向かい龍可を探すのであった。森をさ迷っていた龍可はある少年に出会う。その少年とは。。。

遊星はワールド・ライディング・デュエルGPを目指すライバルチームに拉致される。行方がわからなくなった遊星を必死になって探すアキたち。遊星が捉えられているトレーラーを発見し救出しようとするが、トレーラーが暴走してしまう。そこに謎のDホイールが現れる。その正体とは・・・。

遊星を助けた謎のDホイーラーはシェリーという女性だった。彼女の目的も遊星を仲間に入れることである。ライディングデュエルを行う遊星とシェリー。一進一退の白熱した戦いを繰り広げる。一方、その戦いを真近で見ていたアキはライディングデュエルのすごさを体験し、魅了されるのであった。

遊星は以前戦ったゴーストの事を思い出し、ジャックにデュエルを申し込む。遊星はシンクロ召喚を使わないで戦う方法を模索するが、ジャックに敗戦してしまう。そこに、思い悩む遊星を見つめる覆面の男。その男の目的とは・・・・。

遊星の前に現れた謎の覆面Dホイーラー。シンクロ封じを使う敵に対して己の限界を超えろといい、デュエルを挑んでくる。スピードを上げ、高速でのライディングデュエルを行う覆面Dホイーラーは究極のシンクロ"アクセルシンクロ”を行うのであった。

遊星とシェリーのライディングデュエルを体験したアキは「ライディングデュエル」に魅了され、ライセンスを取得することを決意する。必死に練習するアキをサポートする遊星。そして、徐々にコツを掴んだアキはライセンス取得テストに向かうのであった。遊星たちはアキに新しいD・ホイールをプレゼントする。

D・ホイール窃盗団が出没するようになったネオ童実野シティ。ジャックが窃盗団と思い捕まえた人間はセキュリティの潜入捜査官であった。自分のミスで潜入捜査官に怪我を負わせてしまった思いから、一人窃盗団のもとに向かうジャック。だがジャックを待ち構えていたものは。。。。。

新たな石版がネオ童実野シティに届いたのをきっかけに、ルチアーノはデュエルアカデミアに転校してきた。ルチアーノの狙いは、龍可のエンシェント・フェアリー・ドラゴンを奪うことだった。そして、龍可に親しく話しかけるルチアーノを警戒する龍亞は・・・・。